弊社はBOSSに対応していないモールでも販売しているのでBOSSは使っていないですが、
crossmallの受注管理システムを使用しております。
https://cross-mall.jp/ 現状大手の受注管理システムであれば自動処理やRSL、shopifyなどは最近対応しているところも増えていると思います。一部メール便を自社で発送しているためうちの場合は完全自動ではないですが
crossmallもシステム的には一元自動化も可能だと思います。
目的にされているRSLからの受注→(出来ればオーソリも)→出荷→メール配信
はできます。
選んだ理由としてはクロスモールは従量課金ではなく、モール追加ごとの追加での固定料金体系のため注文数が増えてもコストの負担が増えないことはメリットになります。
料金面での比較感としてはBOSSは楽天利用は完全無料だと思いますので、ヤフショやshopifyの受注件数でコストがどのくらいかかるか計算してみて、
新システム導入をするかの検討材料にされるとよいのかなと思います。
一回だけシステムの移行作業をしたことがありますが結構大変でした(笑)