まず始めにMacBook Airのトラブルについて。
ノートPCの音がうるさいのは内蔵の冷却ファンに溜まったホコリなどが原因で
スムーズにファンが回転できなくなっているのが原因ということがほとんどです。
この状態が悪化していくと、CPUパワーを多く使う処理(仮想Windowsを動作させるのもこれに該当)
が続いた場合に放熱が間に合わず本体がどんどん熱くなり、強制的に電源断が行われたり誤動作します。
その間は通常よりもバッテリーを早く消耗するので、バッテリーライフが落ちたように感じるのではないかと思います。
※もちろん経年劣化でバッテリーがへたった可能性もあります。
分解して冷却ファンを掃除したり、交換するだけで改善する可能性が高いと思いますが、
Apple製品は自分で分解すると保証が受けられなかったり面倒なので
予備のPCを用意して修理に出すのがいい気がします。
冷却ファンが止まってしまった人の事例があったので紹介しておきます。
http://coolmail.cocolog-nifty.com/money/2008/05/macbook_air_8aff.html 続いてお勧めのWindows PCについて。
今後のMac OSとWindowsの使用頻度にもよると思います。
ツールを動かすだけやあまり使用頻度が高くないのであれば、
加島さんご提案のMacを新調して今のMBAをWindows専用にするのもいいと思います。
私のお勧めは仮想Windowsのクラウドサービスです。
月額1,000円程度から24時間稼動の環境が持てるのはとても良いと思います。
外出先などでも利用するためには常にネット接続環境が必要になってしまうデメリットはありますが。